ОРГАНІЗАЦІЯ МІЖГЕННОГО СПЕЙСЕРА 5S РИБОСОМНОЇ ДНК APAMEA MONOGLYPHA (LEPIDOPTERA)

Анотація

Значна частина метеликів - представників надродини Noctuoidea, які поширені на території України, є шкідниками сільськогосподарських культур, що привертає до них особливу увагу дослідників. Зокрема, кормовими рослинами для личинок метеликів роду Apameа є злакові культури. Коректне визначення метеликів-шкідників вимагає проведення молекулярно-генетичних досліджень для створення молекулярних паспортів (баркодингу). Одним із зручних молекулярних маркерів, які застосовуються для порівняння таксонів низького рангу є ділянки 5S рДНК. Ці послідовності тандемно організовані в кластери, де кожна повторювана одиниця (повтор) складається з висококонсервативної кодувальної ділянки та варіабельного міжгенного спейсера (intergenic spacer – IGS). Зважаючи на те, що молекулярна організація 5S рДНК у метеликів є все ще недостатньо дослідженою, метою нашої роботи було проаналізувати IGS 5S рДНК представника роду Apamea – A. monoglypha. Для цього повтори 5S рДНК ампліфікували за допомогою ПЛР, а отримані продукти лігували у плазмідний вектор pJet1.2. Вставки трьох рекомбінантних плазмід,  ApMon1-1, ApMon1-2 та ApMon1-8, які мали очікуваний розмір, сиквенували. Виявлено, що в геномі A. monoglypha присутні декілька структурних варіантів IGS, які відрізняються між собою як за довжиною, так і за нуклеотидною послідовністю. Відсотки ідентичності порівнюваних IGS 5S рДНК варіювали в межах 38,0-76,2%, що свідчить про високий рівень внутрішньогеномного поліморфізму цієї ділянки. В якості потенційних зовнішніх елементів промотору, що можуть брати участь в ініціації та термінації транскрипції, було охарактеризовано АТ-багату ділянку, динуклеотид GC та залишок цитозину, які передують кодувальній ділянці. Водночас oligo-T мотив, який знаходиться безпосередньо після кодувальної ділянки імовірно забезпечує термінацію транскрипції.