5S РДНК ТИМОФІЇВКИ ЛУЧНОЇ PHLEUM PRATENSE L.

Анотація

Ділянки, які кодують 5S рибосомну РНК (5S рДНК), необхідні для забезпечення біогенезу рибосом. Ці ділянки присутні у геномі всіх еукаріот у вигляді численних тандемно організованих одиниць і являють собою універсальну модель для вивчення еволюції повторюваних послідовностей. Кожна повторювана одиниця 5S рДНК складається з еволюційно консервативної кодувальної ділянки та міжгенного спейсера (МГС), який еволюціонує відносно швидко. В МГС присутні елементи зовнішнього промотора та термінатора РНКполімерази ІІІ, які необхідні для транскрипції 5S рДНК. Проте, у різних родинах покритонасінних рослин ці мотиви можуть відрізнятись. Привабливою групою рослин для проведення порівняльних досліджень 5S рДНК є родина Злакові (Poaceae). Проте, для цієї родини організація 5S рДНК залишається все ще вивченою недостатньо. Зокрема, досі нічого невідомо про молекулярну організацію 5S рДНК у такого широко поширеного та економічно важливого роду, як Phlеum. Отже, ми поставили перед собою завдання клонувати, сиквенувати та проаналізувати будову повторюваної ділянки 5S рДНК тимофіївки лучної Ph. pratense L. Встановлено, що в геномі цього виду присутній тільки один варіант повторюваної одиниці 5S рДНК із довжинами кодувальної ділянки та МГС 120 та 209 нп, відповідно. Центральна частина МГС складається з п’яти тандемно організованих дивергованих субповторів, які відрізняються між собою замінами нуклеотидів та невеличкими делеціями/інсерціями. На початку МГС присутня оліго-Т послідовність термінатора транскрипції РНК-полімерази III. У позиціях – 28, – 15 та – 1 нп перед кодувальною ділянкою виявлено консервативні мотиви АТАА, GC та С, які відповідають потенційним елементам зовнішнього промотора 5S рДНК. Порівняльний аналіз отриманих послідовностей свідчить, що розташування мотиву GC у позиції – 15 нп перед кодувальною ділянкою не зустрічається у жодного з досліджених раніше видів покритонасінних рослин, тобто є унікальним. Отримані результати вказують на різницю у ініціації транскрипції РНК- полімерази ІІІ у дво- та однодольних рослин.